Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms