Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msx2Q03358 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms