Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Runx1Q03347 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Runx1Q03347 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Runx1Q03347 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Runx1Q03347 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Runx1Q03347 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Runx1Q03347 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Runx1Q03347 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Runx1Q03347 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Runx1Q03347 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Runx1Q03347 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Runx1Q03347 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms