Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb4Q02738 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms