Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms