Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms