Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms