Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms