Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms