Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms