Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arf1P84078 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arf1P84078 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 469.5 ms