Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms