Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ldb1P70662 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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