Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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