Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 1700126A01Rik-201ENSMUST00000185283 2061 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm44597-202ENSMUST00000203287 3516 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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