Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms