Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CgnP59242 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CgnP59242 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CgnP59242 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CgnP59242 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CgnP59242 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CgnP59242 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CgnP59242 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CgnP59242 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CgnP59242 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CgnP59242 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CgnP59242 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CgnP59242 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CgnP59242 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CgnP59242 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CgnP59242 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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