Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm2P58774 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm2P58774 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm2P58774 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm2P58774 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm2P58774 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm2P58774 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm2P58774 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm2P58774 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms