Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P58686 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P58686 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P58686 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms