Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtswP56203 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtswP56203 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtswP56203 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtswP56203 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtswP56203 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtswP56203 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtswP56203 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CtswP56203 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtswP56203 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtswP56203 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtswP56203 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms