Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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