Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms