Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VdrP48281 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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VdrP48281 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VdrP48281 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VdrP48281 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
VdrP48281 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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