Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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