Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc3P33622 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms