Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rom1P32958 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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