Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxa10P31310 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxa10P31310 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms