Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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