Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Defa3P28310 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms