Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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