Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pde6aP27664 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pde6aP27664 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pde6aP27664 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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