Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms