Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms