Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P20040 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P20040 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P20040 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P20040 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P20040 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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P20040 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P20040 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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