Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18525 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18525 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18525 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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