Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PcnaP17918 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PcnaP17918 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms