Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ptbp1P17225 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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