Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms