Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Psmg4P0C7N9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms