Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
TtrP07309 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms