Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04214 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04214 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04214 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04214 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04214 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04214 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04214 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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P04214 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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P04214 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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