Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P04212 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P04212 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04212 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04212 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04212 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04212 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04212 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04212 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04212 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04212 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04212 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04212 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04212 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04212 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms