Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01649 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P01649 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P01649 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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P01649 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P01649 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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P01649 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P01649 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01649 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P01649 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01649 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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P01649 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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P01649 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01649 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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P01649 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01649 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01649 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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P01649 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01649 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01649 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P01649 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01649 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P01649 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P01649 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01649 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01649 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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P01649 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01649 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01649 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01649 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01649 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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