Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BlmO88700 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BlmO88700 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BlmO88700 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BlmO88700 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BlmO88700 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BlmO88700 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BlmO88700 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms