Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col5a1O88207 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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