Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2f6O54917 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2f6O54917 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms