Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FxnO35943 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms