Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cited2O35740 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms