Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx1aO35526 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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