Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ptpn9O35239 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ptpn9O35239 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ptpn9O35239 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ptpn9O35239 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ptpn9O35239 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ptpn9O35239 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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